その後

Perlを使って生成したソースファイル*1は既にリポジトリで管理されていたことがわかった。エラーが出た原因はVisualCのプロジェクトファイルにその生成したファイルが登録されていないからだった。かー、うかつ過ぎ。
結局src/audio/SDL_audiotypecvt.cと、src/video/SDL_rendercopy.[ch]をプロジェクトへ登録することでコンパイルが完了した。これ、忘れんうちに伝えておかないと、忘れた頃にまた自分ではまるな。むむむ。

*1:src/audio/SDL_audiotypecvt.cのこと。